罗卓瑶生于澳门，毕业于香港大学英文系，1987年进入香港电台电视部工作，任助理编导，协助和编导过拍摄一些电视剧片。1982年至1985年到英国进修电影及电视，其间完成首部剧情片《外国的月亮圆些》，此片在1985年的芝加哥影展中获银奖。

回港后一度加入港台电视部拍摄电视片，作品有《男烧衣》和《象我这样一个女子》。1988年拍成电影《我爱太空人》，此后与方令正紧密合作；1989年拍摄了《潘金莲之前世今生》；1990年《爱在别乡的季节》获意大利都灵电影节评审团特别大奖；1992年《秋月》在洛迦诺影展的金豹大奖，全欧洲艺术电影院协会最佳期电影奖及墨尔本影展最佳影片奖。2000年指导的《遇上1967的女神》是其另一部代表作。她的其他作品还有《诱僧》(1993)等。2009年，执导电影《如梦》吴彦祖、袁泉主演，获得第46届台湾电影金马奖9项提名。